根据结合基团的不同，Ni²⁺亲和层析柱可分为俩类：Ni-IDA琼脂糖凝胶和Ni-NTA琼脂糖凝胶。Ni²⁺有六个螯合价位，其中Ni-IDA螯合了三价，Ni-NTA螯合了四价。所以IDA的载量要比NTA的高，但其弱的结合力使金属离子在洗脱阶段时很容易浸出，与目的蛋白紧密结合，从而导致分离蛋白产量偏低，产品不纯及金属离子污染等问题。而NTA的颗粒粒度均匀，粒径更小，并且螯合镍更稳定，能耐受较高的还原剂，使填料更加稳定，镍离子不易脱落。
      如果你追求高产量，而对蛋白纯度的要求并不高，那么可以选用镍IDA-琼脂糖凝胶；如果对蛋白纯度要求高的话，那么镍NTA-琼脂糖凝胶则是最佳选择。